自考计算机及应用专业的科目设置因地区和时间可能会有所不同，但通常包括以下几个方面：

1. 公共基础课：如马克思主义基本原理概论、中国近现代史纲要、英语（二）、高等数学（工本）等 。
2. 专业核心课：包括Java语言程序设计（一）、概率论与数理统计（二）、离散数学、计算机系统结构、操作系统、C++程序设计、数据结构、软件工程、数据库系统原理、计算机网络原理等 。
3. 实践性环节：部分课程会有相应的实践环节，例如Java语言程序设计（一）（实践）、C++程序设计（实践）、数据结构（实践）、数据库系统原理（实践）等 。
4. 毕业设计：通常要求完成计算机及应用毕业设计，这通常是一个综合性的实践项目，用以展示学生在专业学习中的综合能力 。
5. 换考课程：对于不考外语的考生，可以选择换考课程，如中国文化概论、多媒体技术、管理学原理等 。

请注意，具体的科目设置和考试要求可能会根据教育部门的最新规定有所变化，建议考生在准备自考时，参考当地教育考试机构发布的最新考试大纲和指南。